11月5日，慈禧太后与光绪皇帝一起在仪銮殿接见日本使臣矢野文雄；12月13日，慈禧太后又与光绪皇帝一起在宫中召见英、美、德、法、俄、奥、荷、日等各国驻京使臣的夫人，光绪皇帝还与各位使臣夫人一一握手还礼。这一系列姿态不仅向中外表明光绪皇帝的健康已经大为增进，而且两宫和睦，孝慈相孚，共同治理着这个国家，并不像外界尤其是康、梁等流亡人士所宣传的那样帝后之间势同水火。
此后不久，光绪皇帝的身体状况可能日趋恶化，病情越来越严重。1899年1月22日，清廷通过上谕的方式告知中外“朕体违和，近来服药调理，尚未大愈”。此后一段时间有关坛庙大祀等礼仪性的活动不拟参加，“若勉强亲行，精力恐有未周，进退拜献设有衍仪，转不足以昭诚敬”，故而决定次年正月初十日孟春时享太庙的典礼着派庆亲王奕劻恭代，正月十三日祭祈谷坛着派怡亲王溥静恭代。
2月17日，清廷公开宣布光绪皇帝以上年夏秋之交违和，尚未痊愈，命将太医院脉案，按五日一权，抄发各省督抚阅看。22日，清廷再次公开宣布，光绪皇帝以病未痊愈，恭谢各国驻华公使请觐贺年。光绪皇帝实际上停止了所有的政务活动。